W. M. L. de Wette: Kurze Erklärung der Apostelgeschichte, Vierte Auflage, bearbeitet und stark erweitert von Franz Overbeck, Leipzig 1870 Google
Ueber Entstehung und Recht einer rein historischen Betrachtung der Neutestamentlichen Schriften in der Theologie. Antrittsvorlesung, gehalten in der Aula zu Basel am 7. Juni 1870, Basel 1871
Ueber die Christlichkeit unserer heutigen Theologie. Streit- und Friedensschrift, Leipzig 1873, 21903
Studien zur Geschichte der alten Kirche, Schloss-Chemnitz 1875 Internet Archive
Ueber den pseudojustinischen Brief an Diognet
Ueber die Gesetze der römischen Kaiser von Trajan bis Marc Aurel
Ueber das Verhältniss der alten Kirche zur Sclaverei im römischen Reiche
Zur Geschichte des Kanons. Zwei Abhandlungen, Schloss-Chemnitz 1880
Die Tradition der alten Kirche über den Hebräerbrief
Der neutestamentliche Kanon und das Muratorische Fragment
Das Johannesevangelium. Studien zur Kritik seiner Erforschung, Basel 1911
Vorgeschichte und Jugend der mittelalterlichen Scholastik. Eine Kirchenhistorische Vorlesung, Basel 1917 Internet Archive
Christentum und Kultur. Gedanken und Anmerkungen zur modernen Theologie, Basel 1919
Die sogenannten Scholien des Oekumenius zur Apokalypse, in: Zeitschrift für wissenschaftliche Theologie VII (1864), S. 192–201 Google
Ueber zwei neue Ansichten von Zeugnissen des Papias für die Apostelgeschichte und das vierte Evangelium, in: Zeitschrift für wissenschaftliche Theologie X (1867), S. 35–74.
Ueber ἐν ὁμοιώματι σαρκὸς ἁμαρτίας Röm. 8,3. Offenes Sendschreiben an Herrn Dr. Carl Holsten in Rostock, in: Zeitschrift für wissenschaftliche Theologie XII (1869), S. 178–213
Ueber das Verhältniss Justins des Märtyrers zur Apostelgeschichte, in: Zeitschrift für wissenschaftliche Theologie XV (1872), S. 305–349 Google
Ueber den pseudojustinischen Brief an Diognet, in: Programm für die Rectoratsfeier der Universität Basel, Basel 1872
Ueber die Auffassung des Streits des Paulus mit Petrus in Antiochien (Gal. 2,11ff.) bei den Kirchenvätern, in: Programm zur Rectoratsfeier der Universität Basel, Basel 1877
Aus dem Briefwechsel des Augustin mit Hieronymus, in: Historische Zeitschrift XL (1879), S. 222–259
Ueber die Anfänge der patristischen Literatur, in: Historische Zeitschrift XLVIII (1882), S. 417–472
Zum Danielcitat Herm. Past. IV,2, in: Theologische Litteraturzeitung X (1885), Sp. 341
Ueber die Anfänge der Kirchengeschichtsschreibung, in: Programm zur Rectoratsfeier der Universität Basel, Basel 1892
Die Bischofslisten und die apostolische Nachfolge in der Kirchengeschichte des Eusebius, in: Programm zur Rectoratsfeier der Universität Basel, Basel 1898
Eine Replik, in: Basler Nachrichten, 14. September 1903, Nr. 252
Meine Antwort auf Frau Dr. Förster-Nietzsches neueste Publikationen, ihren Bruder betreffend, in: Frankfurter Zeitung, 10. Dezember 1904, Nr. 343
