Wegener verfasste 170 Veröffentlichungen; davon behandelten 106 meteorologische Themen. Sein bekanntestes Werk behandelte aber seine Theorie der Kontinentalverschiebung, die heute allgemein anerkannt ist.
Die Alfonsinischen Tafeln für den Gebrauch eines modernen Rechners. Inaugural-Dissertation. E. Ebeling, Berlin 1905 Google-USA*
In: Beiträge zur Physik der Atmosphäre. Zeitschrift für die wissenschaftliche Erforschung der höheren Luftschichten. 2. Band. Karl J. Trübner, Straßburg 1906–1908
Über die Flugbahn des am 4. Januar 1906 in Lindenberg aufgestiegenen Registrierballons. 1. Heft, S. 30 Internet Archive = Google-USA*
mit Johan Peter Koch: Die glaciologischen Beobachtungen der Danmark-Expedition. In: Meddelelser om Grønland. Bd. 46 (1917), S. 1–77 Internet Archive
Die Entstehung der Kontinente und Ozeane (= Wilhelm Westphal (Hg.): Die Wissenschaft. Sammlung von Einzeldarstellungen aus den Gebieten der Naturwissenschaften und der Technik, Bd. 66), 4. umgearb. Aufl. Vieweg, Braunschweig 1929
Johan Peter Koch: Durch die weiße Wüste. Die dänische Forschungsreise quer durch Nordgrönland 1912–13. Mit 158 Textabbildungen und 2 Karten. Springer, Berlin 1919 UB Regensburg
