Die Lehre von der Eucharistie in den drei ersten Jahrhunderten: historisch-theologisch Abhandlung. Mainz 1826 Internet Archive
Geschichte der christlichen Kirche. Band 1, Landshut, Wien 1835 Internet Archive
Muhammedʼs Religion nach ihrer inneren Entwicklung und ihrem Einflusse auf das Leben der Völker eine historische Betrachtung. Regensburg 1838 Internet Archive
Lehrbuch der Kirchengeschichte. Band 2, Regensburg 1838 Google
Ueber die gemischten Ehen: Eine Stimme zum Frieden. Regensburg 1838 Google
Der Protestantismus in Bayern und die Kniebeugung. Sendschreiben an Herrn Professor Harleß, derm. Landtagsabgeordneten, Regensburg: Manz 1843 MDZ München, MDZ München, MDZ München
Die Reformation: Ihre innere Entwicklung und ihre Wirkungen im Umfange des lutherischen Bekenntnisses. Regensburg 1848/51
1. Band, zweite, verbesserte und vermehrte Auflage Internet Archive
Briefe und Erklärungen von J. von Döllinger über die Vaticanischen Decrete 1869-1887. München 1890 Internet Archive
Briefwechsel zischen Friedrich Michelis und Ignaz von Döllinger. Veröffentlicht von Matthias Menn in: Internationale kirchliche Zeitschrift: neue Folge der Revue internationale de théologie. Band 2 (1912), Heft 3, S. 319–344, Heft 4, 456–483 e-periodica
Ignaz Döllingers Briefe: an eine junge Freundin, herausgegeben von Heinrich Schrörs. Kempten und München 1914 Internet Archive
Trauerrede auf das Hinscheiden Charlotte Louise Friederike Amalie Therese von Bayern: Gehalten den 3. November 1854 in der königl. Hof- und Stiftskirche zum heil. Cajetan in München. München 1854 Google
Leichenrede gesprochen von Seiner Hochwürden dem Herrn Dr. Johann Joseph Iganz von Döllinger, Stiftsprobst bei St. Cajetan etc. etc. an der Gruft Seiner Hochwürden des Herrn Jacob v. Wifling, k. b. Oberkirchen- und Schulrath im k. Staatsministerium des Innern für Kirchen- und Schulangelegenheiten, Hofstifts-Decan bei St. Cajetan in München ... am 7. Februar 1862. München 1862 MDZ München
Zum Gedächtniß Seiner Majestät des Königs Maximilian II. und seiner Regierung. Dritte Auflage, München 1864 MDZ München
König Maximilian II und die Wissenschaft. München 1864 Internet Archive
Die Universitäten sonst und jetzt. Rectorats-Rede, München 1867 MDZ München
Festrede zur 400jährigen Stiftungsfeier der kgl. Ludwig-Maximilians-Universität München. München 1872 MDZ München
Gedächtniss-Rede auf König Johann von Sachsen in der öffentlichen Sitzung der K. Akademie der Wissenschaften. München 1874 Internet Archive
Aventin und seine Zeit. Rede gehalten im Namen der historischen Classe in der zur Vorfeier des Geburts- und Namensfestes Sr. Majestät des Königs am 25. August 1877 gehaltenen öffentlichen Sitzung der königl. Akademie der Wissenschaften. München 1877 UB Eichstätt-Ingolstadt (PDF)
Peter von Cornelius, Ignaz von Döllinger: Umrisse zu Dante's Paradies. Leipzig 1830 Google
Vorwort in: Die vornehmsten Lehren und Gebräuche der katholischen Kirche in einer Reihe von Vorträgen. Regensburg 1838 Google
Ignaz von Döllinger, Franz Heinrich Reusch: Geschichte der Moralstreitigkeiten in der römisch-katholischen Kirche seit dem sechzehnten Jahrhundert. Nördlingen 1889 Internet Archive
Sion. Eine Stimme in der Kirche für unsere Zeit. Augsburg 1871
Klägliches Ende eines sogenannten „großen Theologen“. 65–71, 73–76 Google
Döllinger durch sich selbst geichtet. S. 437–440, 450–454 Google
Ein Hirtenbrief des Erzbischofs von München in Sachen der Döllinger’schen Bewegung. S. 379–382 Google
Excommnikationsbulle gegen den Herrn Stiftsprobst Dr. v. Döllinger. S. 382–384 Google
Wolfgang Menzel: Döllinger und seine Schule. In: Geschichte der neuesten Jesuitenumtriebe in Deutschland 1870–1872. Stuttgart 1873, S. 169–188 Google
Carl Adolf Cornelius: Gedächtnisrede auf J. von Döllinger gehalten in der öffentlichen Sitzung der k. b. Akademie der Wissenschaften zu München am 28. März 1890. München 1890 UB Eichstätt-Ingolstadt (PDF)
Beda Stubenvoll: Prof. Dr. J. von Döllinger † 10. Januar 1890 Zweite Auflage, Heidelberg 1890 MDZ München
Luise von Kobell: Ignatz von Döllinger. München 1891 Internet Archive
Emil Michael: ''Ignatz von Döllinger. Eine Charakteristik, Innsbruck 1892 Internet Archive
Bibliotheca Döllingeriana. Katalog der Bibliothek des verstorbenen kgl. Universitäts-Professors J. J. J. von Döllinger. Lindauer, München 1893 Internet Archive
Mücke: Papst Leo XIII. und Ignaz von Döllinger: der grösste katholische Theologe aller Jahrhunderte und siegreiche Vorkampfer apostolischer Kircheneinigung gegen des Papstthum; ein neuer Janus oder Zeitspiegel des wahren und falschen Katholicismus. Berlin 1894 Internet Archive
Bernhard Münz: Biographische Blätter. Berlin 1896, S. 245–259 Internet Archive
Philipp Woker: Zu J.J. von Döllingers hundertjähriger Geburtstagsfeier (1799-1899). In: Internationale theologische Zeitschrift = International theological review. Band 7 (1899), Heft 27, S. 449–464 e-periodica
Johann Friedrich: Ignaz von Döllinger: sein Leben auf Grund seines schriftlichen Nachlasses. München 1899/1901
Matthias Menn: Döllinger als Schriftsteller: 1799–1890. In: Internationale theologische Zeitschrift = International theological review. Band 17 (1909), Heft 66, S. 292–310, Heft 67, S. 476–511, Heft 68, S. 713–740 e-periodica
Georg Schwaiger: ''Ignaz von Döllinger. Antrittsvorlesung, gehalten im Auditorium maximum der Universität München am 13. November 1963. München [1963] Internet Archive
Claudius Stein: Ignaz von Döllinger und das Münchner Universitätsjubiläum von 1872. In: Zeitschrift für bayerische Landesgeschichte. 68,2 (2005) S. 853–923 MDZ München
Claudius Stein: Ignaz von Döllinger als Mitglied der Bayerischen Akademie der Wissenschaften und der Historischen Kommission. In: Zeitschrift für bayerische Landesgeschichte, Bd. 72, 2009, München 2009, S. 571–616 MDZ München, Döllingers Vorträge in Historischer Klasse und Gesamtakademie. S. 617–620 MDZ München