Der Reichstag zu Worms im Jahre 1521. Nach den Briefe des päpstlichen Nuntius Hieronymus Aleander. München 1870 Google
Tagebuch geführt während des vatikanischen Konzils. Nördlingen 1871 Google
Tagebuch: Während des vaticanischen Concils geführt, Nördlingen 1871 Internet Archive
Der Jesuit P. Keller als der wahre Verfasser der unter dem Namen Herwarts 1618 in München erschienenen Schrift Ludovicus IV. Imperator defensus. München 1874 Google, MDZ München
Der Mechanismus der vatikanischen Religion. Nach dem Fakultätenbuch der Redemptoristen. Bonn 1875 Google, MDZ München
Beiträge zur Kirchengeschichte des 18. Jahrhunderts: aus dem handschriftlichen Nachlaß des regul. Chorherrn Eusebius Amort. In: Abhandlungen der Historischen Classe der Königlich Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Bd. 13, München 1876 Google, MDZ München
Augsburger Relationen bei Gelegenheit der Visitatio liminum Apostolorum. München 1876 Google, MDZ München
Geschichte des Vatikanischen Konzils, drei Bände, Bonn 1877–1887
Band 1: Vorgeschichte bis zur Eröffnung des Konzils. MDZ München
Band 3,1: Die Geschichte des Konzils bis zum 18. Juli 1870. MDZ München
Band 3,2: Die Geschichte des Konzils bis zum 18. Juli 1870. MDZ München
Zur ältesten Geschichte des Primates in der Kirche, Bonn 1879 MDZ München
Über Francesco Pucci. Franz. In: Sitzungsberichte der königl. bayer. Akademie der Wissenschaften. Historische Classe. München 1880 Google, MDZ München
Beiträge zur Geschichte des Jesuiten-Ordens. Verlag der Bayerischen Akademie der Wissenschaften. München 1881 MDZ München
Über die Unächtheit der Decretale de recipiendis et non recipiendis libris des P. Gelasius. In: Sitzungsberichte der königl. bayer. Akademie der Wissenschaften. Historische Classe. München 1888, S. 54–86 Google, Internet Archive
Die Constantinische Schenkung, Nördlingen 1889 MDZ München
Ignaz von Döllinger: Sein Leben auf Grund seines schriftlichen Nachlasses, drei Bände, München 1899–1901
