Des heiligen Kirchenlehrers Johannes Chrysostomus Commentar zum Galaterbrief, aus dem Griechischen übersetzt und mit kurzen Erläuterungen versehen. In: Valentin Thalhofer: Bibliothek der Kirchenväter: Ausgewählte Schriften des heiligen Chrysostomus. Band 7, Kempten 1882, S. 7–168 Google-USA*IA? = Columbia-USA*
Die erste Entstehung der Organismen nach den Philosophen des Altertums und des Mittelalters, mit besonderer Rücksichtnahme auf Urzeugung. Eichstätt 1885 (Jahres-Bericht über das Bischöfliche Lyceum zu Eichstätt für das Studienjahr 1884/85) UB Eichstätt-Ingolstadt, Google-USA*IA? = Princeton-USA*
Die erste Entstehung der Organismen nach den Philosophen der Neuzeit, mit besonderer Rücksichtnahme auf die Urzeugung. Eichstätt 1888 (Jahres-Bericht über das Bischöfliche Lyceum zu Eichstätt für das Studienjahr 1887/88) UB Eichstätt-Ingolstadt
Die Gründung des sogenannten botanischen Gartens der Fürstbischöfe von Eichstätt auf der Willibaldsburg. In: Sammelblatt des historischen Vereins in Eichstätt. 3. Jahrgang (1888), S. 1–34 UB Eichstätt-Ingolstadt
Der botanische Garten der Fürstbischöfe von Eichstätt. Eine Studie. Eichstätt 1890 (Jahres-Bericht über das Bischöfliche Lyceum zu Eichstätt für das Studienjahr 1889/90) IA = Google-USA* = Harvard-USA*, UB Eichstätt-Ingolstadt
Ueber subjektive Gesichtsempfindungen und -erscheinungen. In: Zeitschrift für Psychologie und Physiologie der Sinnesorgane. 16. Band (1898), S. 35–48 Google-USA*IA? = Penn State-USA*
Altmühltal und Altmühlgebirge. Eine topographisch-geologische Schilderung. Eichstätt 1905; 2., gänzlich umgearbeitete Auflage von Ludwig Wegele, Eichstätt 1929 GND
Kleinere Mitteilungen: Material zu „Rosen Bayerns“. In: Mitteilungen der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der heimischen Flora. 1. Band (1906), S. 530 zobodat.at
Über einige für Bayern neue Rosenarten und mehrere überhaupt neue Artbastarde von Rosen. In: Berichte der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der heimischen Flora. Band 11 (1907), S. 170–175 zobodat.at, UB Frankfurt/M.
Über die Materialien, welche die Römer in ihren Ansiedelungen bei Eichstätt verwendeten. Eichstätt 1908
Die Rosen des südlichen und mittleren Frankenjura: ihr System und ihre phylogenetischen Beziehungen, erörtert mit Hinsicht auf die ganze Gattung Rosa und das allgemeine Deszendenzproblem. München 1910 Cornell-USA*, zobodat.at, Internet Archive = Biodiversity Heritage Library
Zum Bastard Rosa dumetorum Thuill. × tomentosa Sm. In: Allgemeine Botanische Zeitschrift für Systematik, Floristik, Pflanzengeographie etc. 16. Jahrgang (1910), S. 20 zobodat.at, Biodiversity Heritage Library
Die Beziehungen zwischen Donau und Altmühl im Tertiär und Diluvium. In: Geognostische Jahreshefte. 23. Jahrgang 1910 (1911), S. 11–41 California-USA*
Rezension: Umgekehrt ist auch gefahren!. In: Mitteilungen der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der heimischen Flora. Band 2 (1911), S. 342–344 zobodat.at
Das Auftreten von Wasserdampf bei vulkanischen Eruptionen. In: Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie. Jahrgang 1911, S. 777–782 zobodat.at
Die Farben der Blüten und Früchte bei den Rosen und andern einheimischen Phanerogamen. In: Denkschriften der Kgl. bayr. botanischen Gesellschaft in Regensburg. 11. Band (1911), S. 234–289 zobodat.at, Biodiversity Heritage Library
Verzeichnis neuer Formen und Varietäten der Rosenflora Bayerns mit ihren deutschen und lateinischen Diagnosen. In: Mitteilungen der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der heimischen Flora. Band 3 (1913), S. 68–77 zobodat.at
Beobachtungen und Versuche zur Biologie der Rosenblüte und Rosenbefruchtung. In: Berichte der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der Flora. Band 15 (1915), S. 1–16 zobodat.at
Die lithographischen Plattenkalke des obersten Weißjura in Bayern. München 1919 California-USA*
mit Carl Wolfgang Lutz: Erdbeben in Bayern 1908/20. In: Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften zu München. 1921, S. 81–165 zobodat.at, BAdW (PDF)
Philosophie der Natur. 2 Bände, München 1921 (Philosophische Handbibliothek, 3–4); ²1922
Instinkt und verwandte Fragen. In: Klerusblatt. Zeitschrift der katholischen Geistlichen in Bayern und der Pfalz. 6. Jahrgang (1925)
Franz Mayr (Hrsg.): Die Rosen Bayerns. Eine systematische Übersicht der bis 1919 beobachteten Arten und Variationen. Ansbach 1926 (Berichte der Bayerischen Botanischen Gesellschaft, 18) zobodat.at