Geschichte der Päpste seit dem Ausgang des Mittelalters. Mit Benutzung des Päpstlichen Geheim-Archives und vieler anderer Archive, 16 Bände in 22 Teilbänden, Freiburg im Breisgau 1886–1933
5. bis 7. Aufl. Freiburg im Breisgau 1925 [unter dem Titel:]Geschichte der Päpste im Zeitalter der Renaissance bis zur Wahl Pius’ II. Martin V., Eugen IV., Nikolaus V., Kalixtus III.
2. Aufl. Freiburg im Breisgau 1894 [unter dem Titel:]Geschichte der Päpste im Zeitalter der Renaissance. Von der Thronbesteigung Pius’ II. bis zum Tode Sixtus’ IV.Internet Archive, Google
Band 3: Geschichte der Päpste im Zeitalter der Renaissance. Von der Wahl Innozenz’ VIII. bis zum Tode Julius’ II., Freiburg im Breisgau 1895 Internet Archive
Band 3,1: [unter dem Titel:]Geschichte der Päpste im Zeitalter der Renaissance. Von der Wahl Innozenz’ VIII. bis zum Tode Julius’ II. 1484–1513. Erste Abteilung. Innozenz VIII. und Alexander VI.Internet Archive, Kujawische digitale Bibliothek
Band 3,2: [unter dem Titel:]Geschichte der Päpste im Zeitalter der Renaissance. Von der Wahl Innozenz’ VIII. bis zum Tode Julius’ II. 1484–1513. Zweite Abteilung. Pius III. und Julius II.Kujawische digitale Bibliothek
Band 4,2: Geschichte der Päpste im Zeitalter der Renaissance und der Glaubensspaltung. Von der Wahl Leo X. bis zum Tode Klemens VII.’ (1513–1534). Zweite Abteilung: Adrian VI. und Klemens VII., Freiburg im Breisgau 1907 Internet Archive, Internet Archive, Kujawische digitale Bibliothek
Band 9: Geschichte der Päpste im Zeitalter der katholischen Reformation und Restauration. Gregor XIII. (1572–1585), Freiburg im Breisgau 1923 Internet Archive, Internet Archive
Band 10: Geschichte der Päpste im Zeitalter der katholischen Reformation und Restauration. Sixtus V., Urban VII., Gregor XIV. und Innozenz IX. (1585–1591), Freiburg im Breisgau 1926 Internet Archive, Kujawische digitale Bibliothek
Band 11: Geschichte der Päpste im Zeitalter der katholischen Reformation und Restauration. Klemens VIII. (1592–1605), Freiburg im Breisgau 1927 Kujawische digitale Bibliothek
Band 13,1: Geschichte der Päpste im Zeitalter der katholischen Reformation und des Dreißigjährigen Krieges. Erste Abteilung. Gregor XV. (1621–1623). Urban VIII. (1621–1644), erster Teil, Freiburg im Breisgau 1928 Internet Archive, Kujawische digitale Bibliothek
Band 14,1: Geschichte der Päpste im Zeitalter des fürstlichen Absolutismus. Von der Wahl Innozenz’ X. bis zum Tode Innozenz’ XII. (1644–1700). Erste Abteilung. Innozenz X., Alexander VII., Klemens IX und X. (1644–1676), Freiburg im Breisgau 1929 Internet Archive, Kujawische digitale Bibliothek, Masaryk-Universität Brünn
Band 14,2: Geschichte der Päpste im Zeitalter des fürstlichen Absolutismus. Von der Wahl Innozenz’ X. bis zum Tode Innozenz’ XII. (1644–1700). Zweite Abteilung. Innozenz XI., Alexander VIII., Innozenz XII. (1676–1700), Freiburg im Breisgau 1930 Internet Archive, Masaryk-Universität Brünn
Band 15: Geschichte der Päpste im Zeitalter des fürstlichen Absolutismus. Von der Wahl Klemens’ XI. bis zum Tode Klemens’ XII. (1700–1740), Freiburg im Breisgau 1926 Internet Archive, Kujawische digitale Bibliothek
Band 16,1: Geschichte der Päpste im Zeitalter des fürstlichen Absolutismus. Von der Wahl Benedikts XIV. bis zum Tode Pius’ VI. (1740–1799). Erste Abteilung. Benedikt XIV. und Klemens XIII. (1740–1769), Freiburg im Breisgau 1931 Internet Archive, Kujawische digitale Bibliothek
Band 16,2: Geschichte der Päpste im Zeitalter des fürstlichen Absolutismus. Von der Wahl Benedikts XIV. bis zum Tode Pius’ VI. (1740–1799). Zweite Abteilung. Klemens XIV. (1769–1774), Freiburg im Breisgau 1932 Internet Archive, Kujawische digitale Bibliothek
Band 16,3: Geschichte der Päpste im Zeitalter des fürstlichen Absolutismus. Von der Wahl Benedikts XIV. bis zum Tode Pius’ VI. (1740–1799). Dritte Abteilung. Pius VI. (1775–1799), Freiburg im Breisgau 1933 Internet Archive, Kujawische digitale Bibliothek
Johannes Janssen. 1829–1891. Ein Lebensbild, vornehmlich nach den ungedruckten Briefen und Tagebüchern desselben, Freiburg im Breisgau ²1894 Internet Archive, Internet Archive
Zur Beurtheilung Savonarolas († 1498). Kritische Streifzüge, Freiburg im Breisgau 1898 Princeton-USA*
August Reichensperger. 1808-1895. Sein Leben und sein Wirken auf dem Gebiet der Politik, der Kunst und der Wissenschaft, 2 Bde., Freiburg im Breisgau 1899
Leben des Freiherrn Max von Gagern 1810–1889. Ein Beitrag zur politischen und kirchlichen Geschichte des 19. Jahrhunderts. Großenteils nach ungedruckten Quellen, Kempten und München 1912 Google, California-USA*
Conrad von Hötzendorf. Ein Lebensbild nach originalen Quellen und persönlichen Erinnerungen entworfen, Wien 1916 Polnische Nationalbibliothek, OÖLB
Generaloberst Viktor Dankl, der Sieger von Krasnik und Verteidiger Tirols. Beiträge zur Kenntnis seiner Persönlichkeit, Wien und Freiburg im Breisgau 1916 SB Berlin
Die Stadt Rom zu Ende der Renaissance, Freiburg im Breisgau 1916 Internet Archive, Oxford
Stiftspropst Dr. Franz Kaufmann 1862–1920. Ein Lebensbild, vornehmlich nach seinen Briefen entworfen, Freiburg im Breisgau 1921
Charakterbilder katholischer Reformatoren des 16. Jahrhunderts. Ignatius von Loyola, Theresa de Jesús, Filippo Neri, Carlo Borromeo, Freiburg im Breisgau 1924
Der Mainzer Domdekan Dr. Joh. Bapt. Heinrich 1816–1891. Ein Lebensbild nach originalen Quellen und persönlichen Erinnergen, Freiburg im Breisgau 1925
Die Fresken der Sixtinischen Kapelle und Raffaels Fresken in den Stanzen und den Loggien des Vaticans, Freiburg im Breisgau 1925
Tagebücher. Briefe. Erinnerungen, hrsg. von Wilhelm Wühr, Heidelberg 1950
Antonio de Beatis: Die Reise des Kardinals Luigi d’Aragona durch Deutschland, die Niederlande, Frankreich und Oberitalien 1517–1518. Beschrieben von Antonio de Beatis. Als Beitrag zur Kulturgeschichte des ausgehenden Mittelalters veröffentlicht und erläutert (Erläuterungen und Ergänzungen zur Janssens Geschichte des deutschen Volkes, 4,4), Freiburg im Breisgau 1905 Polnische Nationalbibliothek, UB Heidelberg
Allgemeine Dekrete der römischen Inquisition aus den Jahren 1555–1597. Nach dem Notariatsprotokoll des S. Uffizio zum ersten Male veröffentlicht, in: Historisches Jahrbuch 33 (1912), S. 479–549 Internet Archive
Johannes Janssens Briefe, 2 Bde., Freiburg im Breisgau 1920
Band 1: Erster Band. 1847–1873, Freiburg im Breisgau 1920 Internet Archive
Band 2: Zweiter Band. 1874–1891, Freiburg im Breisgau 1920 Internet Archive
Johannes Janssen: Aus dem Leben des Geschichtschreibers Johannes Janssen 1829–1891. Mit einer Charakteristik Janssens, hrsg. von der Görres-Gesellschaft zur Pflege der Wissenschaft im katholischen Deutschland, Köln 1929 Kujawische digitale Bibliothek, Polnische Nationalbibliothek
Ignaz Philipp Dengel (Hrsg.): Das Österreichische Historische Institut in Rom 1901–1913. Festgabe Ludwig von Pastor zum 60. Geburtstage am 31.1.1914 dargebracht, Wien und Freiburg 1914
