Ehemann der Kulturhistorikerin, Schriftstellerin und Übersetzerin Marie Luise Gothein (1863–1931), Bruder des Politikers Georg Gothein (1857–1940), Vater des bildenden Künstlers Werner Gothein (1890–1968) und des Schriftstellers und Renaissanceforschers Percy Gothein (1896–1944) .
Bilder aus der Kulturgeschichte der Pfalz nach dem dreißigjährigen Kriege. Karlsruhe : Braun, 1895 (Badische Neujahrsblätter 5) Google-USA* = Internet Archive
Johann Georg Schlosser als badischer Beamter. In: Neujahrsblätter der badischen historischen Kommission, NF 2 (1899), Winter, Heidelberg 1899. Internet Archive, Internet Archive
Staat und Gesellschaft des Zeitalters der Gegenreformation. In: Friedrich Bezold, Eberhard Gothein, Reinhold Koser: Staat und Gesellschaft der neueren Zeit (bis zur Französischen Revolution) (= Die Kultur der Gegenwart, II,5), B. G. Teubner, Berlin und Leipzig 1908, S. 137–230 Internet Archive, Internet Archive
Die badischen Markgrafschaften im 16. Jahrhundert. In: Neujahrsblätter der badischen historischen Kommission, NF 13 (1910), Winter, Heidelberg 1910. Internet Archive
Krieg und Wirtschaft: Akademische Rede zur Erinnerung an den zweiten Gründer der Universität Karl Friedrich Großherzog von Baden am 21. November 1914. Heidelberg 1914 Internet Archive
Agrarpolitische Wanderungen im Rheinland, Sonder-Auszug aus Staatswissenschaftliche Arbeiten. Festgaben für Karl Knies.Internet Archive
Familie. In: Handwörterbuch der Staatswissenschaften, Dritter Band, 2. Auflage, Jena 1900, S. 790-809Internet Archive
Gesellschaft und Gesellschaftswissenschaft. In: Handwörterbuch der Staatswissenschaften, Vierter Band, 2. Auflage, Jena 1900, S. 201-216 Internet Archive
Renaissance und Reformation. In: Handwörterbuch der Staatswissenschaften, Sechster Band, 2. Auflage, Jena 1901, S. 385-407 Internet Archive
Die Lage des Bauernstandes am Ende des Mittelalters, vornehmlich in Südwestdeutschland. In: Westdeutsche Zeitschrift für Geschichte und Kunst, Jahrgang IV. (1885), S. 1-22 Internet Archive
Die oberrheinischen Lande vor und nach dem dreißigjährigen Kriege. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 1 (1886), S. 1-45 Internet Archive
Die Hofverfassung auf dem Schwarzwald dargestellt an der Geschichte des Gebietes von St. Peter. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 1 (1886), S. 257-316 Internet Archive
Voltaires Briefe an den kurpfälzischen Minister Baron von Beckers. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 2 (1887), S. 273-287 Internet Archive, Internet Archive
Beiträge zur Geschichte des Bergbaus im Schwarzwald. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 2 (1887), S. 385-448 Internet Archive, Internet Archive
Die Landstände der Kurpfalz. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 3 (1888), S. 1-76 Internet Archive
Mannheim im ersten Jahrhundert seines Bestehens. Ein Beitrag zur deutschen Städtegeschichte. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 4 (1889), S. 129-211 Internet Archive
Entstehung und Entwicklung der Murgschifferschaft. Ein Beitrag zur Geschichte des Holzhandels. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 4 (1889), S. 401-455 Internet Archive
Eine Stadterweiterung von Konstanz. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 5 (1890), S. 127-129 Internet Archive
Zur Geschichte der Rheinschifffahrt. In: Westdeutsche Zeitschrift für Geschichte und Kunst, Jahrgang XIV. (1895), S. 231-256 Internet Archive
Beitrag zur Verwaltung der Markgrafschaft Baden unter Karl Friedrich. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 26 (1911), S. 377-414 Internet Archive
Doktordissertationen. Das Uebel und seine Besserung, in: Archiv für Sozialwissenschaft und Sozialpolitik 32 (1911), S. 781–792 Internet Archive
Zwei Episoden badischer Fürstengeschichte. I. Ein unglücklicher Fürstensohn. (Markgraf Ferdinand Maximilian von Baden.) II. Eine tapfere Fürstin (Markgräfin Augusta Maria von Baden-Durlach.) In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 27 (1912), S. 543-561 Internet Archive
Alfred Dove. Ein Nekrolog. In: Zeitschrift für die Geschichte des Oberrheins, N.F. Band 31 (1916), S. 448-450 Internet Archive
Karl Friedrich und die Physiokraten. In: Beilage zur Allgemeinen Zeitung vom 24. Januar 1893, Beilage-Nr. 20, S. 1-4 MDZ; Teil II. In: Beilage zur Allgemeinen Zeitung vom 26. Januar 1893, Beilage-Nr. 22, S. 1-4 MDZ
Die Entstehung und Ausbildung der Hexenprozesse. In: Beilage zur Allgemeinen Zeitung vom 21. März 1901, Nr. 66, S. 1-3 MDZ; Teil II. In: Beilage zur Allgemeinen Zeitung vom 22. März 1901, Nr. 67, S. 3-6 MDZ