Die mosaische Geschichte des Menschen, von seinem Ursprunge bis zum Entstehen der Völker, Frankfurt/Leipzig 1793 UB Freiburg
Vom Ursprunge der menschlichen Erkenntniß in Hinsicht auf die Grundsätze der kantischen Philosophie, Basel 1796 UB Freiburg
Einleitung in die Schriften des neuen Testaments, Erstauflage Basel 1797, Band 1: UB Freiburg, Stuttgart/Tübingen ²1821 Band 1: Google, Band 2: Google), ³1826 (Band 2: Google, 41847, Band 1: UB Freiburg, Band 2: UB Freiburg, Google
Daniel Guildford Wait: An introduction to the writings of the New Testament, London 1827, Band 1: Google, Band 2: Google – englische Übersetzung der 2. Auflage
David Fosdick Jr./Moses Stuart (Übersetzer/Kommentator): Hug’s Introduction to the New Testament, Andover 1836 Google – englische Übersetzung der 3. Auflage
Die Erfindung der Buchstabenschrift, ihr Zustand und frühester Gebrauch im Alterthum, Ulm 1801 UB Freiburg
Untersuchungen über den Mythos der berühmtern Völker der alten Welt, Freiburg 1812 Google
De conjugii Christiani vinculo indissolubili, Freiburg 1816 UB Freiburg
Das Hohe Lied in einer noch unversuchten Deutung, Freiburg 1813 UB Freiburg
Johann Leonhard Hug’s Schutzschrift für seine Deutung des Hohen Liedes, Freiburg 1816 UB Freiburg
Lucubratio de oratione Ciceronis pro M. Marcello, Freiburg 1817 UB Freiburg
De Pentateuchi versione Alexandrina commentatio, Freiburg 1818 UB Freiburg
De opere sex dierum commentatio, Freiburg 1821 UB Freiburg
Rede auf Ferdinand Wanker vor der Albert-Ludwigs hohen Schule, als sie seine Todtenfeyer begieng am 30ten Tage nach seinm Hintritte gesprochen, Freiburg 1824 UB Freiburg
Gedächtnisrede auf Jos. Anton Schinzinger, Freiburg 1828 UB Freiburg
Zur akademischen Feier des hohen Geburtsfestes seiner Königl. Hoheit unsers durchlauchtigsten Großherzogs Karl Leopold Friedrich, Freiburg 1835 UB Freiburg
Rede auf den Hintritt des am 6. Maerz 1836 in Gott entschlafenen hochwürdigsten Erzbischofs und Metropoliten der oberrheinischen Kirchenprovinz Bischofs der Dioezese Freiburg Bernhards I., Freiburg 1836 UB Freiburg
Gutachten über das Leben Jesu, kritisch bearbeitet von Dr. David Friedrich Strauß, Freiburg 1840–1844, Band 1: UB Freiburg, Band 2: UB Freiburg
Karl Grieshaber: Reverendissimo illustrissimoque viro J. Leonardo Hug ... praeceptori, cuius memoriam nulla unquam delebit oblivio, Rastatt 1837 UB Freiburg
