De primordiis artis imprimendi ac praecipue de inventione typographiae Harlemensi, Berolini, 1856 Google
Die Lage der Curia Hostilia und der Curia Julia, München, Wolf, 1858 MDZ München = Google
Die Ruinen Roms und der Campagna, Leipzig, Weigel, 1863 MDZ München = Google
Die Ruinen Roms, 2. verbesserte Ausgabe, Gera-Untermhaus, Köhler, [1878] Internet Archive
Die Ruinen Roms, 2. verbesserte Ausgabe, Leipzig, Weigel, 1879 Google-USA*
Geschichte der Baukunst im Alterthum: Nach den Ergebnissen der neueren wissenschaftlichen Expeditionen bearbeitet, Leipzig, Weigel, 1866 GoogleGoogle, Internet Archive = Google
Festschrift zur Feier des fünfundzwanzigjaehrigen Bestehens des Muenchener Kunstgewerbevereines, Auf Veranlassung des Directoriums und unter Mitwirkung der Liter. Commission des Comité’s redigirt von Franz Reber, München, Wolf & Sohn, 1876 MDZ München
Album der Ruinen Roms: in zweiundvierzig Ansichten und Plänen, nebst einem Stadtplane vom Jahre 1877, Leipzig, Weigel, 1883 Google-USA*
Geschichte der neueren deutschen Kunst vom Ende des vorigen Jahrhunderts bis zur Wiener Ausstellung 1873; mit Berücksichtigung der gleichzeitigen Kunstentwicklung in Frankreich, Belgien, Holland, England, Italien und den Ostseeländern, Stuttgart, Meyer & Zeller, 1876 Michigan-USA*New York-USA*, UB Weimar, Internet Archive = Google-USA*
Geschichte der Neueren deutschen Kunst. Nebst Exkursen über die parallele Kunstentwicklung der übrigen Länder germanischen und romanischen Stammes. Unter Mitwirkung von F. Pecht bearbeitet von Franz von Reber, 2. Aufl. 3 Bände, Leipzig, Haessel, 1884
Kurfürst Maximilian I. von Bayern als Gemäldesammler, Festrede gehalten in der öffentlichen Sitzung der k. b. Akademie der Wissenschaften zu München am 18. November 1892, München, Verlag der k. b. Akademie, 1892 Internet Archive = Google-USA*
Beiträge zur Kenntniss des Baustiles der heroischen Epoche, in: Sitzungsberichte der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Philosophisch-Philologische und Historische Klasse, 1888, 2. Band, München, 1889 Internet Archive, Princeton-USA*
Die Erwerbung von Raphaels Madonna Tempi durch König Ludwig I., in: Jahrbuch für Münchener Geschichte, Bd. 3, 1889, Bamberg MDZ München
Hans Multscher von Ulm, in: Sitzungsberichte der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Philosophisch-Philologische und Historische Klasse, 1898, 2. Band, München, 1899, S. 1–68 Internet Archive, Princeton-USA*
Die Korrespondenz zwischen dem Kronprinzen Ludwig von Bayern und dem Galeriebeamten G. Dillis, Separat-Abdruck aus den Sitzungsberichten der Kgl. Bayer. Akademie der Wissenschaften 1904 Heft III, München, 1904 MDZ München
Die Stellung der Hethiter in der Kunstgeschichte, in: Sitzungsberichte der Königlich Bayerischen Akademie der Wissenschaften Philosophisch-philologische Klasse Jahrgang 1910, 13. Abhandlung, München, Verlag der Königlich Bayrischen Akademie der Wissenschaften, 1910 MDZ München
Über einige Probleme altkretischer Architektur, in: Sitzungsberichte der Königlich Bayerischen Akademie der Wissenschaften Philosophisch-philologische Klasse Jahrgang 1913, 8. Abhandlung, München, 1913 MDZ München
Vitruv: Des Vitruvius zehn Bücher über Architektur, übersetzt und erläutert, 1865 siehe Autorenseite
Max Rooses: Geschichte der Malerschule Antwerpens von Q. Massijs bis zu den letzten Ausläufern der Schule P. P. Rubens. Aus dem Vlämischen übersetzt, München, Riedel
Katalog der Gemälde-Sammlung der Kgl. älteren Pinakothek in München, Einleitung von Franz Reber, München, Amtliche Ausgabe, 1884 Princeton-USA*, weitere Auflagen München, Bruckmann, München, Verlaganstalt für Kunst und Wissenschaft
