3. Auflage. Mit einem Anhange aus dem Nachlasse eines Visionairs: des J. Fr. Oberlin, gewesenen Pfarrers im Steinthale, und einem Fragment über die Sprache des Wachens. Brockhaus, Leipzig 1840 MDZ München, Internet Archive
4. Auflage. Mit einem Anhang: Die Sprache des Wachens. Ein Fragment. Friedrich Heinrich Ranke (Hrsg.). Brockhaus, Leipzig 1862 Internet Archive, MDZ München
Altes und Neues aus dem Gebiet der innren Seelenkunde.
Die Urwelt und die Fixsterne. Eine Zugabe zu den Ansichten von der Nachtseite der Naturwissenschaft. Arnold, Dresden 1822 MDZ München, Internet Archive
Wanderbüchlein eines reisenden Gelehrten nach Salzburg, Tirol und der Lombardey. Palm und Enke, Erlangen 1823 MDZ München, MDZ München
2. Ausgabe, mit der Reise über das Wormser Joch nach Venedig, Erlangen 1834 Internet Archive
Peurbach und Regiomontan, die Wiederbegründer einer selbstständigen und unmittelbaren Erforschung der Natur in Europa. Palm und Enke, Erlangen 1828 MDZ München
Züge aus dem Leben des Johann Friedrich Oberlin, gewesenen Pfarrers im Steinthal bei Straßburg. Raw, Nürnberg 1828 MDZ München, 4. Auflage, 1832 MDZ München, 5. Auflage, 1834 MDZ München, 7. Auflage, 1842 MDZ München
Die Geschichte der Seele. 2 Bände. Cotta, Stuttgart 1830, 2. Auflage, 1833 Internet Archive
Kurze Geschichte der Reformation und des Reformators in Schottland, Johannes Knox (= Kleinere Schriften zur Beförderung des christlichen Glaubens und Lebens, 15). Augsburg 1831 Internet Archive
Erinnerungen an Bernhard Overberg. Erlangen 1835 Google, MDZ München
Ueber die Einheit im Bauplane der Erdveste. Eine Rede gehalten zu München in der öffentlichen Sitzung der königlichen Akademie der Wissenschaften zu Feier ihres 76sten Sitzungstages am 28. März 1835. Lit.-art. Anst., München 1835 ULB Düsseldorf
Die Geschichte der Natur, als zweite, gänzlich umgearbeitete Auflage der allgemeinen Naturgeschichte. 4 Bände. Palm und Enke, Erlangen 1835–1837
Die Krankheiten und Störungen der menschlichen Seele (ein Nachtrag zu des Verfassers Geschichte der Seele). Cotta, Stuttgart und Tübingen 1845 MDZ München
Biographieen und Erzählungen. 4 Bde. in 3 Tln.Heyder, Erlangen 1847-1848.
Die Krankheiten und Störungen der menschlichen Seele. Ein Nachtrag zu des Verfassers Geschichte der Seele. Cotta, Stuttgart und Tübingen 1845 Internet Archive
Seebilder. Ein Buch zur Unterhaltung und Belehrung. Palm und Enke, Erlangen 1850 Internet Archive
Das Weltgebäude, die Erde, und die Zeiten des Menschen auf der Erde. Palm und Enke, Erlangen 1852 MDZ München
Die Geschichte der Natur, als dritte, gänzlich umgearbeitete Auflage der allgemeinen Naturgeschichte. Auch als selbstständiges Werk mit dem Titel: Das Weltgebäude, die Erde, und die Zeiten des Menschen auf der Erde. 2 Bände. Palm und Enke, Erlangen 1852–1853
Lehrbuch der Sternkunde für Schulen und zum Selbstunterrichte. Heyder & Zimmer, Frankfurt a. M. und Erlangen 1857 MDZ München
Parabeln aus dem Buche der sichtbaren Werke. München 1858 MDZ München
Die Geschichte von Bayern für Schulen. München 1860 MDZ München
Naturgeschichte in Bildern.
Band 1: Naturgeschichte der Säugethiere. Stuttgart und Esslingen 1860 MDZ München
Band 2: Naturgeschichte der Vögel. 2. Auflage, Stuttgart und Esslingen 1860 MDZ München
Band 3: Naturgeschichte der Amphibien, Fische, Weich- und Schaalenthiere, Jnsekten, Würmer und Strahlenthiere. Stuttgart und Esslingen [ca. 1860] MDZ München
Anthologie aus den Werken. Mit Biographie (= Meyer’s Groschen-Bibliothek der Deutschen Classiker, Band 226). Hildburghausen/New York [ca. 1870] MDZ München
Naturgeschichte des Tier-, Pflanzen- und Mineralreichs. Schreiber, Esslingen und München
Band 1.3. Naturgeschichte der Reptilien, Amphibien, Fische, Insekten, Krebstiere, Würmer, Weichtiere, Stachelhäuter, Pflanzentiere und Urtiere. 8. Auflage, Schreiber, Esslingen und München [um 1886] TU Braunschweig
Band 2: Naturgeschichte des Pflanzenreiches. 4. Auflage MPIZ Köln
Die Abentheuer des Fiedlers zu Schiras. In: Phöbus, 4. und 5. Stück, 1808, S. 25–44, E-Text Bibliotheca Augustana
Fragmente aus einer Vorlesung. In: Phöbus, 4. und 5. Stück, 1808, S. 67–68, E-Text Bibliotheca Augustana
John Bunyan: Des Christen Wallfahrt nach der himmlischen Stadt. Frei, nach dem Englischen, bearbeitet von Heinrich Ranke. Mit einer Einleitung von G. H. Schubert. Heyder, Erlangen 1832 MDZ München
Albert Steinbeck: Der Dichter ein Seher, oder über die innige Verbindung der Poesie und der Sprache mit dem Hellsehn. Nebst einer einleitenden Abhandlung: „der organische Leib und die Sprache“ von Gotthilf Heinrich von Schubert. Göschen, Leipzig 1836 MDZ München
Julius Hamberger (Hrsg.): Des Württembergischen Prälaten Friedrich Christoph Oetinger Selbstbiographie. Mit einem Vorwort von Gotthilf Heinrich von Schubert. Liesching, Stuttgart 1845 MDZ München
Ehrengedächtniß des Henrich Steffens. In: Gelehrte Anzeigen. 77–80 (1846) MDZ München
Erinnerungen aus dem Leben Ihrer königlichen Hoheit Helene Louise Herzogin von Orleans gebornen Prinzessin von Mecklenburg-Schwerin. Nach ihren eigenen Briefen zusammengestellt. 3. Auflage. München 1859 MDZ München, 6. Auflage. München 1860 MDZ München
Hans-Georg von Arburg: "Die Kirche und die Götter" (1804) : ein frühromantischer Roman in literatur- und medizinhistorischer Sicht. In: Athenäum 11 (2001), S. 93–121 HU Berlin
