Beiträge in Zeitschrift des Historischen Vereins für Schwaben und Neuburg. Augsburg
Das Todesjahr des Markgrafen Heinrich II. von Burgau. Band 18, 1891, S. 235–236 MDZ München
Die Vikarierbruderschaft bei St. Moriz, ihre Gründung, Verfassung und ihr ältestes Anniversarienbuch. Band 19, 1892, S. 88–109 MDZ München
Der Humanist Veit Bild, Mönch bei St. Ulrich. Sein Leben und sein Briefwechsel. Band 20, 1893, S. 173–227 MDZ München
Mittelalterliche Wandgemälde bei St. Peter am Perlach. Band 21, 1894, S. 139–148 MDZ München
Geschichte des Domkreuzganges in Augsburg. Band 24, 1896, S. 97–112 MDZ München
Quellen zur Baugeschichte des Augsburger Domes in der gothischen Stilperiode. Band 24, 1896, S. 113–122 MDZ München
Die Herrschaftsgebiete im heutigen Regierungsbezirk Schwaben und Neuburg nach dem Stand um Mitte 1801. Kartographisch dargestellt von Hugo Schröder. Stuttgart 1906 MDZ München. Rezension von Otto Rieder in: Forschungen zur Geschichte Bayerns. 14 (1906), S. 332–337 Internet Archive, Georg Grupp: Historisches Jahrbuch. 28 (1907), S. 372–374 Internet Archive
Die älteste Urkunde für St. Peter in Augsburg. Band 50, 1932/33, S. 9–28 MDZ München
Der Verein und die Bistumsgeschichte. Band 51, 1934/35, S. 143–156 MDZ München
Die Erwerbung des Patronatsrechtes auf die Pfarrei St. Moriz durch Jakob Fugger. In: Diözesan-Archiv von Schwaben. Band 9, Stuttgart 1892, S. 33–44 UB Heidelberg
Das Kloster Wettenhausen Schicksale im Schwedenkriege. In: Diözesan-Archiv von Schwaben. Band 10, Stuttgart 1893
Beiträge in: Archiv für christliche Kunst: Organ des Rottenburger Diözesan-Kunstvereins.
Ein übertünchtes Gemälde Martin Schaffners in der ehemaligen Klosterkirche zu Wettenhausen. Band 11, Stuttgart 1893, S. 34–37 UB Heidelberg
Die Renaissance-Monstranz von St. Max in Ausburg. Band 13, Stuttgart 1895, S. 61–64 UB Heidelberg
Ueber Künstler-Inschriften an Altarwerken . Band 14, Stuttgart 1896, S. 54 UB Heidelberg
Die frühesten datirten Bilder Hans Holbeins des Aelteren im Dome zu Augsburg: eine Erwiderung. Band 20, Stuttgart 1902, S. 77–78 UB Heidelberg
Quellenbeiträge zur süddeutschen Goldschmiedekunst vom 15. bis Ende des 18. Jahrhunderts. Band 22, Stuttgart 1904, S. 93–100 UB Heidelberg
Beiträge zur Kunsttopographie und Künstlergeschichte des bayerischen Kreises Schwaben. Band 25, Stuttgart 1907, S. 71–73, 83–86, 89–91, 97–100, UB Heidelberg
Das Traditionsbuch und das älteste Einkünfte-Verzeichnis des Klosters Ursberg. In: Jahresbericht des Historischen Vereins Dillingen. 7 (1894) S. 3–39 UB Augsburg
Dionysius von Rehlingen, Reichsprälat von Wettenhausen 1658–1692. In: Diözesan-Archiv von Schwaben. Band 13, Nr. 5, 1895, S. 65–71, S. 85–90 UB Heidelberg
Kurze Geschichte des Stiftes und der Kirche St. Peter in Augsburg. Augsburg 1895 UB Augsburg
Beiträge in: Jahrbuch des Historischen Vereins Dillingen an der Donau.
Untersuchung gegen Mag. Kaspar Haslach, Prediger in Dillingen, wegen Verdachtes der Häresie (1522). Band 8, 1895, S. 11–25 MDZ München
Die Verkündung der Bulle Exurge Domine durch Bischof Christoph von Augsburg 1520. Band 9, 1896, S. 144–172 MDZ München
Der Lauinger Schimmel. Bd. 10, 1897, S. 197–198 MDZ München
Die Monumente des Augsburger Domkreuzganges. Band 10, 1897, S. 33–91 MDZ München, Fortsetzung Band 11, 1898, S. 31–114 MDZ München
Vitus Felix Rigl, Maler in Dillingen. Band 14, 1901, S. 147–150 MDZ München
Kunst und Künstler vergangener Jahrhunderte in Dillingen. 18 (1905) S. 92–105 MDZ München, Fortsetzung 19 (1906), S. 1–18 MDZ München
Die staatsrechtlichen Verhältnisse im bayerischen Schwaben um 1801. 19 (1906), S. 134–220 MDZ München
Beiträge zur Wirtschafts- und Verfassungsgeschichte des Hochstiftes Augsburgs. I. Peter Gaisbergs Statistik des Amtes Oberdorf. 20 (1907), S. 123–153 MDZ München
Die Bibliothek. Band 22, 1909, S. 275–282 MDZ München
Aus dem Jahrtagsbuch des Grossen Klosters in Dillingen. Band 23, 1910, S. 217–222 UB Augsburg
Beiträge zur Häusergeschichte Dilllingens. Band 25, 1912, S. 276–289 MDZ München
Die Bibliothek. Zugänge von Juli 1912 bis Ende Juni 1914, Band 26, 1913, S. 256–267 MDZ München
Die Bibliothek. Zugänge von Juli 1914 bis Ende Juni 1915, Band 27, 1914, S. 152–157 MDZ München
Pfarrkirche und Schloß zu Haunsheim. Band 30, 1917, S. 120–138 MDZ München
Die Ortsnamen im Amtsbezirk Dillingen. Band 33, 1920 S. 33–64 MDZ München, Fortsetzung Band 34, 1921, S. 1–45 MDZ München
Der heilige Ulrich in der Volksüberlieferung. Band 36, 1923, S. 2–21 MDZ München
Das Geschlecht der Ritter von Dillingen. Band 36, 1923, S. 22–40 MDZ München
Schwenningen in Bayern – Geschichte eines schwäbischen Dorfes. Band 37, 1924, S. 1–90 MDZ München
Die Domkirche zu Augsburg, ein Führer durch ihre Baugeschichte und ihre Merkwürdigkeiten. Sonderdruck aus: Augsburger Postzeitung, Unterhaltungsbeilage, August 1900. Augsburg 1900 UB Augsburg
Der hl. Ulrich und die Reklusin Wiborada. In: Historisches Jahrbuch. 22 (1901), S. 276–284 Internet Archive
Kunsthistorische Notizen, gesammelt auf einer kleinen Wanderung im Allgäu. In: Deutsche Gaue: Zeitschrift für Gesellschaftswissenschaft und Landeskunde. Band 3, Kaufbeuren 1901, S. 195–199 Google
Das Bistum Augsburg, historisch und statistisch beschrieben. Augsburg 1864–1940
Das Landkapitel Kaufbeuren, von Anton von Steichele, fortgesetzt von Alfred Schröder, Band 6, Augsburg 1896–1904 MDZ München
Das Landkapitel Oberdorf. Band 7, Augsburg 1906–1910 MDZ München
Das Landkapitel Schwabmünchen. Band 8, Augsburg 1912–1932 MDZ München
Beiträge in: Zeitschrift für christliche Kunst.
Das "Sakrarium" in der Kirche zum hl. Kreuz in Augsburg: ein Beitrag zur Entwicklungsgeschichte der Monstranz.Band 10, Düsseldorf 1897, S.193–206 UB Heidelberg
Spätgothik und Protestantismus. Band 13, Düsseldorf 1900, S. 149–158 UB Heidelberg
Pazaureks Prachtwerk über Kirchliche Goldschmiedekunst. Band 28, Düsseldorf 1915, S. 53–65 UB Heidelberg
Beiträge in: Die Christliche Kunst; Monatsschrift für alle Gebiete der christlichen Kunst und Kunstwissenschaft.
Ein Pfarrkirchenbau von Dominikus Zimmermann. 2 (1905/06), S. 49–52 Internet Archive
Die Hofkirche in Neuburg a. D. Ein Beitrag zur Geschichte der Spätrenaissance in Süddeutschland. 2 (1905/06), S. 206–215 Internet Archive
Widmung an Dr. Alfred Schröder. In: Jahrbuch des Historischen Vereins Dillingen an der Donau Band. 47/48 1934 und 1935 MDZ München
Dem Bisthumshistoriker Alfred Schröder zum Gedächtnis. In: Das Bistum Augsburg, historisch und statistisch beschrieben. Band 9, Augsburg 1934–1939, S. 4–12 MDZ München
Andreas Bigelmair: Nachruf Alfred Schröder. In: Zeitschrift für Bayerische Landesgeschichte. Band 8, Augsburg 1935, S. 174–176 ZBLG