Arno, erster Erzbischof von Salzburg (785–821). K. k. Hof- und Staatsdruckerei, Wien 1863 MDZ München
Blüthe der nationalen Dynastien (Babenberger – Přemysliden – Arpaden) in den österreichischen, böhmischen und ungarischen Ländern vom J. 1000 bis 1276 (= Oesterreichische Geschichte für das Volk, 3). Prandel & Ewald, Wien 1866 Internet Archive, MDZ München
Die Kriege Kaiser Heinrich’s II. mit Herzog Bolesław I. von Polen. K. k. Hof- und Staatsdruckerei, Wien 1868 MDZ München
Das älteste Matrikel-Buch der Universität Krakau. Beschreibung und Auszüge. Festschrift zur 400jährigen Jubelfeier der Ludwigs-Maximilians-Universität zu München. Wagner, Innsbruck 1872 MDZ München
Die polnische Geschichtschreibung des Mittelalters (= Preisschriften gekrönt und herausgegeben von der fürstlich Jablonowski’schen Gesellschaft, 17). Hirzel, Leipzig 1873 Internet Archive, MDZ München
Der österreichische Erbfolgestreit nach dem Tode des Königs Ladislaus Posthumus, 1457–58. Wien, 1879
Rudolf von Habsburg und der österreichische Staatsgedanke. Wien, 1882
Über das Rechtsverfahren Rudolfs von Habsburg gegen Ottokar von Böhmen. Wien, 1887
Franz Josef I. Rede gehalten bei der aus Anlass der Errichtung des Standbildes Seiner Majestät des Kaisers veranstalteten Festfeier der Universität Wien. Selbstverlag der k. k. Universität, Wien 1888 Internet Archive
Zwei Jahre belgischer Geschichte 1791–92. Wien, 1891
Belgien unter der Generalstatthalterschaft Erzherzog Karls 1793–94. Wien, 1893–94
Erzherzog Karl von Oesterreich. Lebensbild. Wien 1895
Zur deutschen Kaiserpolitik Oesterreichs: ein Beitrag zur Geschichte des Revolutionsjahres 1795. Wien, 1899
Quellen zur Geschichte der deutschen Kaiserpolitik Oesterreichs während der französischen Revolutionskriege 1790–1801. Wien, 1882–1885, 1890
3. Band: Quellen zur Geschichte der Politik Oesterreichs während der französischen Revolutionskriege (1793–1797). Mit besonderer Berücksichtigung der Verhältnisse Oesterreichs zu Frankreich und Preussen. Urkunden, Staatsschriften, diplomatische und militärische Actenstücke, sowie vertrauliche Correspondenzen nach bisher ungedruckten Original-Documenten und Copien der k. k. oesterreichischen Archive. Mit Unterstützung des Kais. und Kön. Reichs-Kriegsministeriums herausgegeben von der Kais. Akademie der Wissenschaften. 1. Band: Anfänge des Ministeriums Thugut (Mai bis December 1793). Braumüller, Wien 1882 MDZ München
4. Band: Quellen zur Geschichte der Politik Oesterreichs während der französischen Revolutionskriege (1793–1797). Mit besonderer Berücksichtigung der Verhältnisse Oesterreichs zu Frankreich und Preussen. Urkunden, Staatsschriften, diplomatische und militärische Actenstücke, sowie vertrauliche Correspondenzen nach bisher ungedruckten Original-Documenten und Copien der k. k. oesterreichischen Archive. Mit Unterstützung des Kais. und Kön. Reichs-Kriegsministeriums herausgegeben von der Kais. Akademie der Wissenschaften. 2. Band: Räumung Belgiens. – ‚Finis Poloniae.‘ (Januar bis September 1794). Braumüller, Wien 1885 MDZ München
Zeißberg, Heinrich, Ritter von. In: Meyers Konversations-Lexikon. 4. Auflage. Band 18. Bibliographisches Institut, Leipzig u. Wien 1891, S. 1000 retro|bib
† Heinrich v. Zeißberg. In: Neue Freie Presse, Abendblatt, 27. Mai 1899, S. 2 ÖNB-ANNO
Anton Schlossar: Heinrich R. v. Zeißberg (Ein Gedenkblatt). In: Neue Freie Presse, Abendblatt, 25. Juli 1899, S. 4 ÖNB-ANNO
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